তীব্র খাদ্যাভাবের সময় কোষের লাইসোসোমের প্রাচীর ফেটে যায় এবং আবদ্ধকৃত এনজাইম বের হয়ে কোষের অন্য অঙ্গাণুগুলোকে ধ্বংস করে দেয়, যাকে বলা হয় অটোফ্যাগি। আবার প্রতিকূল পরিবেশে অনেক সময় লাইসোসোমের এনজাইম সমগ্র কোষটিকে পরিপাক করে ফেলে, যাকে বলা হয় অটোলাইসিস। অটোফ্যাগি এবং অটোলাইসিসের কারণে লাইসোসোমকে আত্মঘাতী থলিকা বলা হয়।