প্রধান মূল : যে মূল বীজের ভ্রূণমূল হতে উৎপন্ন হয়ে সরাসরি মাটির ভেতরে প্রবেশ করে শাখা-প্রশাখা বিস্তার করে তাকে প্রধান মূল বলে। সাধারণত দ্বিবীজপত্রী উদ্ভিদের মূল প্রধান মূল হয়ে থাকে। যেমন- আম।
গুচ্ছ মূল : যে মূল ভ্রূণমূল থেকে উৎপন্ন না হয়ে কাণ্ডের গোঁড়ায় একগোছা সরু মূল হিসেবে উৎপন্ন হয় তাকে গুচ্ছমূল বলে। সাধারণত একবীজপত্রী উদ্ভিদের মূল গুচ্ছ মূল হয়ে থাকে। যেমন- ধান।